技術(shù)服務(wù)

轉(zhuǎn)錄組高通量測序

RNA-Seq役首,是基于新一代測序技術(shù)的轉(zhuǎn)錄組學研究方法:首先提取生物樣品的全部轉(zhuǎn)錄的RNA并進行mRNA富集尝丐,然后反轉(zhuǎn)錄為cDNA后進行的新一代高通量測序,在此基礎(chǔ)上進行片段的拼接組裝衡奥,從而可得到一個個的轉(zhuǎn)錄本爹袁,進而可以形成對該生物樣品當前發(fā)育狀態(tài)的基因表達狀況的全局了解。不同階段或部位的生物樣品的RNA-Seq轉(zhuǎn)錄組進行比較分析矮固,則可以在轉(zhuǎn)錄層面得到基因表達水平的變化失息,針對關(guān)鍵基因則可以進行代謝通路(Pathway)的構(gòu)建。 

 

 樣品類型:總RNA档址;血液盹兢;組織樣本;細胞

樣品濃度:≥50 ng/ul守伸;

樣品總量:>3ug绎秒;≥3ml;≥0.3g尼摹;≥3x106-107

樣品純度:OD260/280≥1.8见芹,OD260/230≥1.0,260nm處有正常峰值蠢涝。

RNA完整性: RIN≥7.0玄呛;28S/18S≥1.5;圖譜基線無上抬和二;5S峰正常徘铝。

樣品數(shù):建議20個樣本以上,尤其對于機理方面的研究建議根據(jù)不同患病

時期選取不同階段的梯度樣本儿咱。每個樣本5個以上的重復庭砍。(樣本數(shù)越多越容易獲得功能基因)

 

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