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微生物多樣性/擴(kuò)增子測(cè)序
技術(shù)簡(jiǎn)介
微生物擴(kuò)增子測(cè)序主要通過(guò)直接擴(kuò)增環(huán)境總 DNA 的特定區(qū)域缤底,繞過(guò)微生物培養(yǎng)瓶頸顾患,高效評(píng)估多樣品環(huán)境微生物分布、豐度變化和群落組成情況个唧。隨著高通量測(cè)序技術(shù)的不斷發(fā)展江解,微生物擴(kuò)增子測(cè)序技術(shù)已成為環(huán)境微生物群落比較和差異分析的主流研究手段之一。
針對(duì)不同研究需求徙歼,一般選擇擴(kuò)增 16S 高變區(qū)來(lái)區(qū)分環(huán)境樣品的細(xì)菌和古菌群落犁河,ITS 區(qū)域擴(kuò)增用以評(píng)估真菌群落,原生動(dòng)物等為主的真核微生物群落研究可通過(guò) 18S 高變區(qū)測(cè)序來(lái)實(shí)現(xiàn) 魄梯。此外桨螺,也可通過(guò)特定的功能基因測(cè)序等來(lái)揭示特定功能相關(guān)的環(huán)境微生物群落分布。