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全基因組DNA甲基化測(cè)序
全基因組DNA甲基化測(cè)序(Whole Genome Bisulfite Sequencing,WGBS)技術(shù)服務(wù)
全基因組DNA甲基化測(cè)序是將重亞硫酸鹽處理方法和Illumina HiSeq高通量測(cè)序平臺(tái)相結(jié)合畏陕,對(duì)有參考基因組的物種進(jìn)行全基因組水平的甲基化研究配乓。WGBS可以達(dá)到單堿基分辨率,精確分析每一個(gè)胞嘧啶的甲基化狀 態(tài)惠毁,從而構(gòu)建精細(xì)的全基因組DNA甲基化圖譜犹芹。
樣本要求:DNA樣品總量: ≥6 μg,DNA樣品濃度: ≥100 ng/μL
分析內(nèi)容包括:
1鞠绰、參考序列比對(duì):C位點(diǎn)覆蓋度統(tǒng)計(jì)腰埂、比對(duì)率統(tǒng)計(jì)、測(cè)序深度統(tǒng)計(jì)
2蜈膨、甲基化分析:甲基化水平統(tǒng)計(jì)屿笼、全基因組甲基化水平統(tǒng)計(jì)牺荠、染色體水平甲基化密度分布、不同基因組功能元件甲基化分布統(tǒng)計(jì)驴一、CpG, CHG, CHH甲基化比例統(tǒng)計(jì)
3休雌、差異甲基化區(qū)域分析:DMR相關(guān)基因功能注釋、DMR相關(guān)基因富集分析